美國在台協會是一非營利性民間機構，於1979年1月1日美國政府改變對台灣的外交承認後不久成立。1979年4月10日通過的《台灣關係法》，授權繼續「美國人民與台灣人民之間的商務、文化及其他關係」。同時它也規定「由美國總統或美國各政府機關所進行或執行與台灣有關的任何計畫、活動或其他關係，應依據總統指示的方式及範圍，透過美國在台協會完成、執行之」。美國國務院經由與該會所簽定的合約，提供美國在台協會大部份的經費及運作指導。美國國會透過制定台灣關係法，也在美國在台協會的運作上擔任監督的角色。

美國在台協會台北辦事處共有職員550人以上，從事各種代表美國利益相關的工作，包括商業服務、農產品銷售、領事服務及文化交流。